Zarząd Stowarzyszenia wybierany jest na okres 4 lat spośród członków zwyczajnych Stowarzyszenia. Członkowie Zarządu rozdzielają funkcje między sobą zwykłą większością głosów. W skład Zarządu Stowarzyszenia wchodzą prezes, trzej zastępcy, sekretarz, skarbnik i trzech do dziewięciu członków Zarządu.
Skład Zarządu na kadencję 2025-2029
dr Jolanta Juza – Prezes
dr hab. Maria Płonka, prof.UEK – I-szy Wiceprezes
dr Marzena Piszczek – Wiceprezes
mgr Sebastian Tomsia – Wiceprezes
mgr Elżbieta Braś – Skarbnik
mgr Halina Wojtal-Lubińska – Sekretarz
dr Magdalena Dołhasz, prof.UEK – Członek
mgr Mirosław Chechelski – Członek
mgr Konrad Hernik – Członek
mgr Józef Laskowski – Członek
mgr Joanna Olbert-Jaki – Członek
Komisja Rewizyjna
dr Halina Smutek – Przewodnicząca
dr Krzysztof Stepaniuk – Z-ca Przewodniczącej
mgr Paweł Szafraniec – Sekretarz
Sąd Koleżeński
dr Małgorzata Kosała – Przewodnicząca
dr Tomasz Rojek – Członek
prof. dr hab. Maria Sierpińska – Członek
Byli prezesi Stowarzyszenia Absolwentów UEK
prof. dr hab. Wiesław Nalepa (oficjalnie od 1969 r. do 1981 r.)
dr hab. Krystyna Rajzer, prof. UEK (od 1981 r. do 1986 r.)
prof. dr hab. Andrzej Szromnik (od 1986 r. do 2009 r.)
prof. dr hab. Anna Czubała (od 2009 r. do 2013 r.)
dr Leszek Strzembicki (od 2013 do 2017 r.)